Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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