Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GRIN2AQ12879 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms