Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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