Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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