Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms