Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms