Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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