Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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