Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TPRNQ4KMQ1 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TPRNQ4KMQ1 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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