Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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KNOP1Q1ED39 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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KNOP1Q1ED39 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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KNOP1Q1ED39 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
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KNOP1Q1ED39 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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