Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms