Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.38
LAMA3Q16787 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LAMA3Q16787 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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