Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCAQ16586 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms