Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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