Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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