Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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