Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NR1I3Q14994 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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