Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPNMBQ14956 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms