Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQLEQ14534 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQLEQ14534 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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