Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL9A2Q14055 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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