Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGB1Q14028 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGB1Q14028 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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