Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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PKP1Q13835 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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