Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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