Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATMQ13315 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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