Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF6Q13247 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms