Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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