Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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IFT88Q13099 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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IFT88Q13099 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IFT88Q13099 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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