Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HSPB3Q12988 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HSPB3Q12988 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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