Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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