Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRDP23468 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRDP23468 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRDP23468 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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