Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms