Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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