Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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