Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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