Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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