Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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CFAP47Q6ZTR5 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CFAP47Q6ZTR5 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CFAP47Q6ZTR5 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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