Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPROQ16827 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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