Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HIF1AQ16665 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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