Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ECM1Q16610 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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