Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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