Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
FXNQ16595 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FXNQ16595 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FXNQ16595 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FXNQ16595 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms