Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms