Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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NEDD8Q15843 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD8Q15843 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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