Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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