Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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