Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SS18Q15532 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms