Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CNN3Q15417 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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