Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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UBE3CQ15386 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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UBE3CQ15386 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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UBE3CQ15386 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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UBE3CQ15386 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
UBE3CQ15386 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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