Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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SMCO1Q147U7 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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