Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL9A3Q14050 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL9A3Q14050 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL9A3Q14050 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL9A3Q14050 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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